Městské hradby – historické jádro města obepíná téměř souvislý pás zachovaného opevnění. Brány se sice nedochovaly, ale součástí hradeb jsou bašty, které je možné navštívit.
Kašna na náměstí – zdobí náměstí Svobody. Úpravou prošla v roce 1928 podle návrhu Josefa Kvasničky, od něhož pochází alegorická socha Svobody.
Vodňanské Benátky – říká se tak malebnému zákoutí u středověkého mlýnského náhonu s kamenným klenutým mostem s krucifixem a sochou sv. Jana Nepomuckého.
Kostel Narození Panny Marie – nejvýznamnější stavební památka ve Vodňanech z roku 1327.
Městská galerie – návštěvníkům představuje pamětní síně Františka Heritese a Julia Zeyera, sál Mikoláše Alše, obrazárnu i unikátní soubor křepického zlata, které je považováno za nejkrásnější v Čechách.
Městské muzeum – stálá expozice se věnuje rybářské tradici ve Vodňanech.
Muzeum mlynářského řemesla – najdete je v objektu Mosteckého mlýna. V provozu je tu i malá vodní elektrárna.
Rybářské muzeum – pro milovníky rybaření je tu pestrá expozice historických rybářských potřeb i akvária, ve kterých je umístěno kolem stovky ryb, žijících nejen na našem území, ale třeba i v daleké Amazonii.